Có nhiều điểm khác biệt giữa chuột cống và chuột nhắt, chẳng hạn như kích thước, hành vi và hình dạng của mõm. Chuột thường dài từ 4 đến 8 inch, bao gồm cả đuôi, với mõm có hình tam giác. Chuột cống có mõm cùn và lớn hơn nhiều, dài tới gần 16 inch.
Sự khác biệt giữa chuột cống và chuột nhắt vượt ra ngoài các đặc điểm vật lý. Các nhà khoa học đã phát hiện ra rằng hai loài gặm nhấm có những đặc điểm hành vi rất khác nhau. Chuột cống có xu hướng thận trọng hơn, trong khi chuột cống có xu hướng tò mò và tìm hiểu xung quanh. Chuột cần thời gian để làm quen với môi trường xung quanh. Điều này giải thích tại sao chuột bị bắt nhanh hơn nhiều so với chuột khi đặt bẫy.
Chuột cũng có thể sinh sản thường xuyên hơn chuột cống. Một con chuột cái có thể sinh 10 lần một năm, trong khi một con chuột cái trung bình chỉ có 6 kỳ mang thai. Tuy nhiên, chuột có xu hướng sống lâu hơn, lên đến 1,5 năm, trong khi tuổi thọ trung bình của chuột là từ 9 đến 12 tháng.
Chuột rất sợ chuột và không sống trong cùng một khu vực vì sợ bị ăn thịt. Mùi hương của chuột không chỉ cảnh báo chuột đang ở gần mà còn tạo ra ảnh hưởng xấu đến quá trình sinh sản và hành vi của chuột.
