Ruồi ngủ trong thời gian ngắn vào ban đêm ở nhiều nơi khác nhau như trên trần nhà và sàn nhà. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng giống như con người, ruồi có chế độ ngủ và nghỉ ngơi.
Ruồi không ngủ sâu như con người và chúng ngủ trong khoảng thời gian ngắn hơn nhiều. Rất khó để nghiên cứu sâu hơn về chu kỳ ngủ của ruồi. Khi nghiên cứu mô hình giấc ngủ của con người, các nhà khoa học có công cụ để đo lường hoạt động của não bộ. Loại nghiên cứu này gần như không thể với ruồi, điều này khiến nhiều câu hỏi chưa được giải đáp. Nghiên cứu về giấc ngủ của ruồi hay các côn trùng khác giúp các nhà nghiên cứu tìm hiểu thêm về kiểu ngủ của con người và động vật.