Rùa hộp phương Đông có chế độ ăn phong phú và đa dạng, bao gồm côn trùng, thực vật và nấm. Chế độ ăn đa dạng và cấu tạo tiêu hóa khó khăn này cho phép rùa hộp tồn tại ngay cả khi nguồn thức ăn yêu thích của chúng không có sẵn, giúp tạo nên sự thành công của loài mặc dù chúng thành thục sinh dục chậm và số lượng con cái thấp.
Rùa hộp không đặc biệt kén ăn và chúng có hệ tiêu hóa mạnh mẽ. Khi còn nhỏ, chế độ ăn của chúng chủ yếu bao gồm côn trùng, bao gồm cả sên và giun. Khi trưởng thành, rùa hộp phương Đông hút nhiều thực vật hơn làm nguồn dinh dưỡng chính của chúng, mặc dù thỉnh thoảng chúng vẫn thích ăn côn trùng. Cả rùa hộp phương Đông chưa trưởng thành và trưởng thành đều tiêu thụ xác động vật chết, hoặc xác động vật, khi có sẵn. Họ tiêu thụ một lượng lớn quả mọng, trái cây và rau quả. Rùa hộp phương Đông cũng ăn nấm và có khả năng tiêu hóa an toàn nhiều loài nấm độc đối với người và động vật khác.
Những người đang cân nhắc việc nuôi rùa hộp phương Đông làm vật nuôi nên cung cấp cho chúng chế độ ăn uống đa dạng giống như khi chúng ăn trong tự nhiên để đảm bảo chúng luôn vui vẻ và khỏe mạnh. Nếu không, thiếu hụt vitamin và khoáng chất có thể xảy ra, dẫn đến dị tật, sức khỏe kém và tử vong. Việc chọn một con rùa hộp được nuôi nhốt làm vật nuôi cũng rất quan trọng để tránh gây nguy cơ tuyệt chủng trong tự nhiên.