Pterodactyls là sinh vật ăn thịt chủ yếu ăn cá. Cái miệng dài của chúng chứa khoảng 90 chiếc răng, cho phép chúng dễ dàng xúc cá và nhanh chóng nhai chúng thành những miếng nhỏ dễ tiêu hóa. Trái ngược với những gì được tin tưởng rộng rãi, pterodactyls là loài bò sát bay chứ không phải là chim, và các loài chim hiện đại không tiến hóa từ chúng.
Pterodactyls sống trong kỷ Jura. Trong thời gian đó, các khối đất liền lớn bị chia cắt thành các lục địa, khiến các đại dương mới được hình thành và các biển nội địa rộng lớn cũng rất nhiều. Do đó, sinh vật biển rất phong phú và đa dạng, và các loài săn mồi tiến hóa tương xứng.
Pterodactyls cũng ăn các loài bò sát và côn trùng nhỏ, đặc biệt là khi chúng còn nhỏ, nhưng cá và các sinh vật biển khác là chủ yếu trong chế độ ăn của chúng. Là những người nhặt rác, họ cũng ăn xác động vật. Chúng hoàn toàn là loài ăn thịt và hoàn toàn không ăn bất kỳ loại thực vật nào.
Hóa thạch Pterodactyl đã được phát hiện rất phong phú ở vùng Bavaria, nơi ngày nay là Đức. Trong kỷ Jura, khu vực này chủ yếu được tạo thành từ các đầm lầy và đất ngập nước và nằm ở rìa biển. Hóa thạch Pterodactyl đã được tìm thấy ở nhiều nơi khác trên thế giới, nhưng hóa thạch được tìm thấy ở Bavaria là một trong những nơi được bảo quản tốt nhất.
Sự kiện tuyệt chủng xảy ra trong kỷ Cretacious-Paleogene đã ảnh hưởng nghiêm trọng đến sinh vật biển trên toàn thế giới, có nghĩa là nguồn thức ăn cho pterodactyls trở nên cực kỳ hạn chế trong thời gian này.
