Theo Mayo Clinic, phân màu đất sét nhạt hoặc trắng hơn là màu nâu thông thường. Vì phân có màu nâu từ mật do gan tiết ra, phân màu đất sét là dấu hiệu có thể của tắc nghẽn ống mật hoặc nhiễm trùng gan. Medline Plus lưu ý rằng các nguyên nhân khác gây ra phân có màu đất sét bao gồm viêm gan, khối u trong gan, u nang đường mật, sỏi mật và sử dụng thuốc trị tiêu chảy có chứa một lượng lớn bismuth subsalicylate.
Theo ghi nhận của Mayo Clinic, màu sắc của phân được xác định bởi thức ăn được tiêu thụ, cũng như lượng mật có trong phân. Tiêu thụ rau lá xanh, thực phẩm bổ sung sắt hoặc màu thực phẩm xanh có thể khiến phân có màu xanh. Nếu thức ăn đi qua hệ tiêu hóa quá nhanh, phân cũng có thể có màu xanh.
Phân có mùi hôi, có màu vàng và nhờn cho thấy có mỡ thừa, có thể là do rối loạn hấp thu. Tiêu thụ gluten cũng có thể dẫn đến loại phân này.
Phân đen có thể cho thấy xuất huyết ở đường tiêu hóa trên, nhưng tiêu thụ cam thảo đen, một số chất bổ sung sắt và bismuth subsalicylate cũng có thể khiến phân có màu đen. Phân màu đỏ tươi có thể cho thấy chảy máu ở đường tiêu hóa dưới hoặc chảy máu do bệnh trĩ. Ăn quả nam việt quất, các sản phẩm từ cà chua, củ cải đường hoặc thực phẩm có chứa phẩm màu thực phẩm màu đỏ cũng có thể gây ra phân màu đỏ tươi.