Những bất lợi của hội nhập khu vực bao gồm khả năng tài khóa hạn chế, tập trung hóa văn hóa, tạo ra các khối thương mại, chuyển hướng thương mại và từ bỏ chủ quyền ở một mức độ nào đó. Hội nhập khu vực đề cập đến các hiệp định kinh tế và chính trị khác nhau được hình thành giữa các quốc gia có chủ quyền.
Một số ví dụ về các hiệp ước hội nhập khu vực bao gồm hiệp ước Hiệp hội các quốc gia Đông Nam Á, Liên minh Châu Âu, Hiệp định Thương mại Tự do Bắc Mỹ và Tổ chức Các nước Xuất khẩu Dầu mỏ.
Một số hiệp ước hội nhập khu vực, chẳng hạn như Liên minh Châu Âu, tạo ra một đồng tiền chung và điều này dẫn đến khủng hoảng tài khóa. Với sự hội nhập khu vực, các quốc gia riêng lẻ không thể kiểm soát việc cung cấp tiền tệ của họ để đáp ứng các điều kiện kinh tế của họ. Khi một thực thể quyền lực hơn kiểm soát đơn vị tiền tệ đó, chẳng hạn như đồng euro, các quốc gia riêng lẻ sẽ từ bỏ quyền kiểm soát tiền tệ của họ và điều này làm suy yếu nền kinh tế của họ.
Hội nhập khu vực dẫn đến tập trung hóa văn hóa, điều này có thể làm mất đi các nền văn hóa độc đáo trong một khu vực. Ví dụ: Liên minh châu Âu chỉ coi một số ngôn ngữ là phương tiện giao tiếp chính thức, bỏ qua các ngôn ngữ được các cộng đồng xa xôi ở châu Âu sử dụng, chẳng hạn như tiếng Breton, tiếng Wales và tiếng Frisian.
Hầu hết các hội nhập khu vực có xu hướng gia tăng các rào cản đối với tất cả các quốc gia không phải là thành viên, dẫn đến việc hình thành các khối thương mại. Khi các rào cản thương mại được tạo ra, các quốc gia chuyển hướng thương mại sang các nước thành viên bất kể tổn thất mà họ có thể phải gánh chịu. Ví dụ: một quốc gia thành viên ngừng giao dịch với một quốc gia không phải là thành viên sản xuất hàng hóa với giá rẻ hơn và chọn một quốc gia thành viên sản xuất cùng một loại hàng hóa với chi phí cao hơn.
Khi các hiệp ước hội nhập khu vực được hình thành, các nước thành viên được yêu cầu từ bỏ một số quyền hạn đối với các chính sách quan trọng, chẳng hạn như chính sách tài khóa, thương mại và tiền tệ.
