Rừng nhiệt đới Congo là nơi sinh sống của khoảng 280 loài bò sát, bao gồm rắn, cá sấu và rùa cạn. Trải dài trên sáu quốc gia châu Phi, lưu vực Congo là rừng mưa nhiệt đới lớn thứ hai trên thế giới và là nơi sinh sống của một số loài động vật hoang dã nguy cấp nhất và ngoạn mục nhất ở châu Phi.
Rùa lưng bản lề rừng là một loài rùa bản địa của rừng nhiệt đới Guinea-Congo ở Tây và Trung Phi. Loài phát triển mạnh ở những vùng đầm lầy ven sông suối. Không giống như các loài rùa cạn khác, rùa lưng bản lề rừng chỉ có thể đẻ từ 2 đến 5 quả trứng một lần trên mặt đất phủ đầy lá.
Lưu vực Congo là nơi sinh sống của một số loài rắn độc trên thế giới, bao gồm rắn hổ mang và rắn hổ mang. Cá voi Gaboon sinh sống ở savan và rừng nhiệt đới ở châu Phi cận Sahara. Chúng không chỉ là loài rắn độc nặng nhất mà còn có răng nanh dài nhất và lượng nọc độc cao nhất trong các loài rắn độc. Vipers Gaboon là những kẻ tấn công nhanh, mặc dù chúng được coi là khoan dung và sẽ không cắn trừ khi bị khiêu khích nghiêm trọng.
Cá sấu mõm mảnh châu Phi sống ở sông, đầm lầy, ao và hồ trong rừng nhiệt đới Congo và các khu vực khác của Tây và Trung Phi. Cá sấu có một chiếc mõm cực kỳ mảnh mai nên giới hạn chế độ ăn uống của chúng đối với cá, động vật lưỡng cư, động vật giáp xác và động vật có vú nhỏ. Đây là loài cá sấu ít được biết đến nhất và cũng là loài cá sấu duy nhất có thể leo cao tới vài mét trong các chi của cây đổ.