Tủ ấm, nồi hấp và lò phản ứng sinh học là ba thiết bị được các nhà vi sinh vật học sử dụng. Mỗi máy thực hiện một chức năng chuyên biệt trong việc nghiên cứu vi khuẩn, vi rút và các vi sinh vật khác.
Tủ ấm duy trì các điều kiện môi trường tối ưu, giúp các nhà vi sinh vật phát triển vi khuẩn dễ dàng hơn. Sử dụng lồng ấp, một nhà vi sinh vật học có thể kiểm soát độ ẩm, nhiệt độ và mức oxy. Môi trường tăng trưởng được đặt bên trong tủ ấm để đảm bảo vi sinh vật có các chất dinh dưỡng cần thiết để sinh sôi.
Các nhà vi sinh học phải ngăn ngừa sự lây nhiễm chéo mẫu của họ. Để làm được điều này, họ tiệt trùng dụng cụ và vật dụng sau khi sử dụng. Nồi hấp để thiết bị tiếp xúc với hơi nước bão hòa ở áp suất cao, tiêu diệt vi khuẩn và các vi sinh vật khác. Nồi hấp thường được sử dụng để khử trùng các thiết bị bằng thủy tinh và kim loại, nhưng không thể dùng để tiệt trùng đồ nhựa vì nhựa nóng chảy ở nhiệt độ cao như vậy.
Lò phản ứng sinh học tạo điều kiện thuận lợi cho sự phát triển của các sinh vật được sử dụng cho các ứng dụng công nghệ sinh học. Thiết bị này thường được sử dụng để nuôi cấy các sinh vật được sử dụng trong sản xuất vắc xin và thuốc. Giống như một lồng ấp, một lò phản ứng sinh học cho phép nhà vi sinh vật kiểm soát các điều kiện tăng trưởng. Bảng điều khiển của lò phản ứng sinh học có các cài đặt cho mức độ pH, mức oxy, tốc độ khuấy, thời gian cảm ứng và phân phối chất dinh dưỡng. Một buồng lên men là một ví dụ về lò phản ứng sinh học. Loại buồng này cho phép các nhà vi sinh học sử dụng quá trình lên men quy mô lớn để tạo ra các sinh vật được sử dụng trong sản xuất hormone và vắc-xin.