Ngài Isaac Newton có một em trai cùng cha khác mẹ và hai em gái cùng cha khác mẹ. Cha ông mất trước khi Newton được sinh ra và mẹ ông tái hôn khi ông được hai tuổi.
Theo Đại học St. Andrews, Isaac Newton không có một tuổi thơ êm đềm. Anh được bà nội nuôi dưỡng cho đến khi anh khoảng 10 tuổi và được coi như trẻ mồ côi, mặc dù mẹ anh vẫn còn sống. Newton không thích cha dượng của mình, người đã mất khi Newton 10 tuổi. Sau cái chết của cha dượng, Newton sống trong một đại gia đình bao gồm mẹ, bà, anh trai cùng cha khác mẹ và các chị em cùng cha khác mẹ. Anh ấy ở với một gia đình khác khi còn đi học.