Các vùng nước chính ở Peru bao gồm Hồ Titicaca, Hồ Llanganuco, sông Amazon, sông Ucayali, sông Madre de Dios và sông Marañón. Ngoài ra, Thái Bình Dương giáp với Peru ở phía tây của nó.
Peru có nhiều phụ lưu nhỏ hơn trong khu vực Amazon của nó, với ước tính khoảng 5.343 dặm các phụ lưu có thể điều hướng được trên hệ thống Amazon. Hồ Titicaca, nằm trên biên giới của Peru với Bolivia, có khoảng 129 dặm sông nhánh có thể đi lại được.
Peru nằm ở phía tây của Nam Mỹ và Lima là thủ đô của nó. Đất nước có ba vùng địa lý chính: vùng đồng bằng ven biển, vùng cao hiểm trở và vùng rừng núi thấp. Những khu vực này tạo cho Peru một khí hậu đa dạng, có thể ẩm, lạnh, mưa hoặc khô tùy theo khu vực.