Một ví dụ về phương pháp luận là chiến lược mà giáo viên sử dụng để quyết định họ nên sử dụng trò chơi hoặc công cụ giảng dạy nào để thực hành kỹ năng trừ với một nhóm lớn học sinh. Phương pháp luận thường đề cập đến phần trong một luận văn, nơi một học giả vạch ra kế hoạch thu thập và sắp xếp thông tin của cô ấy.
Phương pháp luận không chỉ là sự biện minh cho một kế hoạch đã chọn. Nó là kết quả của sự phân tích và tìm tòi. Một bác sĩ vật lý trị liệu có thể có hàng tá bài tập tăng cường sức mạnh để lựa chọn, nhưng phương pháp của ông ấy là hệ thống mà ông ấy sử dụng để phù hợp với các bài tập với chấn thương, khả năng, mục tiêu và các cân nhắc y tế khác của bệnh nhân.
Trước khi tiến hành thử nghiệm, nhà khoa học nghiên cứu xác định phương pháp nghiên cứu nào sẽ trả lại kết quả hợp lệ. Cô ấy phải có một hệ thống để xác định lựa chọn nào là tốt nhất. Các quy trình hoặc phương pháp luận thực tế của cô ấy có thể bị ảnh hưởng bởi các nguyên tắc, cân nhắc về ngân sách, các đối tượng thử nghiệm có sẵn hoặc giới hạn về thiết bị.
Phương pháp luận của một bài báo nghiên cứu có thể rất đơn giản hoặc khá phức tạp. Trong một lĩnh vực nghiên cứu, chẳng hạn như tâm thần học hoặc xã hội học, nhà nghiên cứu phải quyết định xem cách tiếp cận định tính hoặc định lượng để thu thập dữ liệu phù hợp hơn. Dữ liệu được phân tích bằng cách sử dụng suy luận quy nạp hoặc suy diễn. Ngoài ra, phương pháp luận bị ảnh hưởng bởi các dự án nghiên cứu trước đó hoặc song song và các công trình đã xuất bản. Phần cuối cùng của phương pháp luận là kế hoạch ghi lại và truyền đạt kết quả nghiên cứu.