Một số nhược điểm khi làm việc theo nhóm bao gồm khả năng xung đột giữa các thành viên trong nhóm, một số thành viên không tương thích với các thành viên khác và việc chia nhỏ công việc có thể quá tốn thời gian. Mặc dù nói chung, làm việc theo nhóm trong một công ty được coi là một điều tích cực, nhưng đôi khi nó có thể phản tác dụng.
Khi ban giám đốc đang xem xét việc thành lập một nhóm để thực hiện một dự án trong công ty, điều đầu tiên cần xem xét là liệu các thành viên trong nhóm có làm việc tốt với nhau hay không. Ví dụ, nếu có xung đột đã biết giữa hai hoặc nhiều thành viên, việc đưa họ vào cùng một nhóm có thể không mang lại kết quả mong muốn. Khi có xung đột giữa các thành viên trong nhóm, làm việc theo nhóm sẽ không hiệu quả.
Ban quản lý cũng nên xem xét mức độ làm việc của các thành viên tiềm năng trong nhóm với những người khác. Điều tự nhiên là một số người có xu hướng tạo ra chất lượng công việc tốt hơn một mình trong khi những người khác phát triển mạnh trong khi có thể động não với đồng nghiệp của họ. Nếu một nhân viên là người cô độc, rất có thể họ không phải là người phù hợp tốt với một nhóm.
Đôi khi, câu ngạn ngữ cũ "quá nhiều đầu bếp làm hỏng món súp" là đúng và có thể được áp dụng trong một số trường hợp để làm việc theo nhóm. Khi cân nhắc việc thành lập một nhóm, ban giám đốc cũng nên nghĩ đến việc liệu nó có hiệu quả về mặt chi phí hay không. Đôi khi, quá nhiều người cùng làm việc trong một dự án có xu hướng làm vẩn đục nước hơn là làm cho mọi thứ trở nên rõ ràng và hợp lý.
