Một trong những nhược điểm chính của việc sử dụng hệ thống quản lý cơ sở dữ liệu, hoặc DBMS, là chi phí tương đối lớn liên quan đến thiết lập ban đầu của DBMS. Cùng với khả năng căng thẳng về tài chính, sự phức tạp của thiết lập một DBMS cũng tốn kém về thời gian và nhân lực.
Cùng với chi phí thiết lập cụ thể, có những chi phí liên tục khác liên quan đến việc tạo và sử dụng DBMS.
- Có thể cần phần cứng bổ sung để lưu trữ và xử lý cơ sở dữ liệu thông tin mới.
- Chi phí bảo trì tăng theo quy mô và tốc độ phát triển của chính cơ sở dữ liệu.
- Chi phí đào tạo - DBMS về bản chất là một hệ thống phức tạp và để mọi người có thể sử dụng chức năng của nó, họ cần hiểu hệ thống và cách sử dụng nó một cách thấu đáo.
- Nhu cầu bảo mật đối với DBMS rất cao và thường yêu cầu các tính năng bảo mật nâng cao thường tốn kém.
Về bản chất, các hệ thống cơ sở dữ liệu phải hoạt động trên một loạt các ứng dụng, không giống như các chương trình được thiết kế để giải quyết các vấn đề cụ thể. Do đó, chúng có thể khiến một số ứng dụng nhất định chạy chậm hơn trước đây. Chúng cũng có thể dẫn đến các hoạt động kém hiệu quả hơn vì chúng không được tối ưu hóa cho bất kỳ ứng dụng đơn lẻ nào.
DBMS, mặc dù chúng cung cấp quyền truy cập, tổ chức và phân tích dữ liệu, nhưng có thể không phải là giải pháp khả thi hoặc giải pháp tốt nhất cho các hoạt động rất nhỏ, do một người thực hiện mà chi phí và độ phức tạp không được đảm bảo.
