Gấu trúc khổng lồ có ít kẻ thù tự nhiên, nhưng con người là kẻ nguy hiểm nhất trong số chúng. Báo tuyết là kẻ săn mồi nổi tiếng đối với những con gấu trúc khổng lồ, cũng như bầy chó hoang có thể bắt lạc đàn con.
Dân số ngày càng tăng ở Trung Quốc đã làm cạn kiệt các khu rừng tre, nơi gấu trúc khổng lồ sinh sống và kiếm ăn, và sự trải rộng ở các đô thị ở Trung Quốc một phần là nguyên nhân khiến dân số gấu trúc khổng lồ ngày càng giảm. Các nhà khoa học thuộc Bộ Lâm nghiệp tin rằng chỉ còn khoảng 1.000 con gấu trúc khổng lồ còn trong tự nhiên ở Trung Quốc và chính phủ Trung Quốc đã hợp tác với Quỹ Động vật Hoang dã Thế giới (WWF) để tăng dân số gấu trúc bằng cách tăng cường các chương trình nhân giống và nâng cao nhận thức của cộng đồng về hoàn cảnh của sinh vật này.