Hai điểm khác biệt chính giữa niềm tin Methodist và Presbyterian là những người Methodists bác bỏ học thuyết tiền định của người Calvin trong khi những người theo thuyết Presbyterian chấp nhận nó và nhà thờ Methodist được tổ chức theo các đường lối giám mục truyền thống, trong khi những người theo thuyết Presbyterian có hệ thống lãnh đạo độc đáo của riêng họ bằng cách các trưởng lão (hoặc "người trưởng lão"). Mặt khác, hai giáo phái Cơ đốc giáo này có nhiều phẩm chất giống nhau.
Việc chấp nhận hay bác bỏ học thuyết tiền định của người Calvin là một sự khác biệt cơ bản và sâu rộng. Tóm lại, học thuyết của John Calvin cho rằng chỉ một số người nhất định mới được cứu rỗi, trong khi những người còn lại được Chúa định sẵn (hoặc "dành" cho sự chết tiệt).
Nói cách khác, không giống như tất cả các giáo phái Cơ đốc chính khác, người Trưởng lão tin rằng Đức Chúa Trời đã chủ động lựa chọn mọi người để đáp lại lời mời cứu rỗi của Ngài.
Tổ chức của Chủ nghĩa Trưởng lão là một điểm khác biệt quan trọng khác. Các trưởng lão được giáo dân bầu chọn và phong các chức vụ quyền hạn. Sau đó, vai trò của họ là phục vụ lợi ích của hội chúng với tư cách là một phần của cơ quan quản lý, hay còn gọi là "phiên họp". Khi một số phiên họp lại với nhau để thảo luận về các công việc của nhà thờ, họ được gọi là "hội trưởng". Nói chung, nhiều hội nghị tiền nhiệm được gọi là một "hội đồng". Khi họp lại với nhau để thảo luận các vấn đề liên quan đến giáo phái nói chung, các đại hội đồng hình thành "Đại hội đồng Trưởng lão".
