Hai địa hình chính ở Đông Nam Á là Bán đảo Malaysia và Quần đảo Malaysia. Bán đảo Malaysia bao gồm các dãy núi cao bao quanh bởi các đồng bằng và đồng bằng ven biển. Quần đảo Malaysia nằm ở phía nam bán đảo và là một trong những khu vực núi lửa hoạt động mạnh nhất thế giới. Nhiều hòn đảo trong quần đảo có nhiều núi và do núi lửa hình thành.
Dãy núi là một trong những đối tượng địa lý phổ biến nhất ở Đông Nam Á. Dãy núi Tenasserim là dãy núi trung tâm ở Bán đảo Malaysia. Nhiều dãy núi khác chạy song song với dãy Tenasserim. Các dãy này bao gồm dãy Trường Sơn Bắc ở Việt Nam, dãy Bintang ở Thái Lan và dãy Tahan ở Malaysia và Thái Lan. Các phần của chân núi Himalaya nằm ở Myanmar, nơi tạo nên phần phía bắc của khu vực.
Quần đảo Malaysia cũng có nhiều núi và có nhiều núi lửa đang hoạt động. Quần đảo này bao gồm hơn 25.000 hòn đảo. Những hòn đảo này được nhóm lại trong các quần đảo nhỏ hơn bao gồm Indonesia, quần đảo Philippines và New Guinea và các đảo xung quanh nó. Chúng được hình thành bởi 4 mảng kiến tạo hội tụ và được tạo hình bởi những ngọn núi lửa đang hoạt động. Những ngọn núi lửa nổi tiếng như Krakatoa, Merapi và Tambora đều nằm ở Indonesia.
