Các địa hình chính ở Pakistan bao gồm đèo Khyber, đèo Bolan, cao nguyên Balochistan, đồng bằng sông Indus, Hindu Kush, dãy Karakoram và dãy Himalaya. Độ cao cao nhất ở Pakistan là đỉnh núi K2 của Himalaya, cao 28.269 feet so với mực nước biển.
Các khu vực miền núi khác ở Pakistan bao gồm dãy Safed Koh, dãy Sulaiman và dãy Kirthar, tất cả đều nằm ở một phần của đất nước được gọi là cao nguyên phía bắc. Những con đèo giữa những ngọn núi này cắt qua biên giới giữa Pakistan và nước láng giềng Afghanistan bao gồm đèo Khojak và đèo Broghol xa hơn về phía bắc. Khu vực đồng bằng Indus, được đặc trưng là khu vực chịu ảnh hưởng của sông Indus, bao gồm cả lưu vực thượng và hạ lưu sông Indus. Cao nguyên Potwar chứa các độ cao cao hơn ở đồng bằng Indus và dẫn đến chân của dãy núi Himalaya. Sa mạc Thung lũng Indus cũng nằm trong vùng đồng bằng Indus. Đồng bằng Punjab là khu vực giữa sông Indus và biên giới với Ấn Độ. Cao nguyên Balochistan nằm ở phía tây nam của đất nước và dẫn đến biên giới với Iran. Sa mạc Kharan nằm ở phía tây nam của đất nước. Pakistan trải dài cả hai mảng kiến tạo Á-Âu và Ấn Độ.