Bọt biển lọc các hạt thức ăn ra khỏi nước bằng cách đẩy nước đi qua các thể xốp của chúng bằng một dòng điện thu nhỏ tự tạo, đưa các hạt vào trong tầm với của các thành lỗ chân lông nơi các tế bào hấp thụ chúng. Bọt biển là những sinh vật phức tạp có các tế bào thực hiện nhiều nhiệm vụ khác nhau như hướng dòng nước qua bọt biển, hút chất dinh dưỡng từ thức ăn và nhiều thứ khác.
Các tác nhân cơ bắp lọc nước qua các lỗ xốp được gọi là trùng roi. Chúng đập nước thành một dòng điện nhất quán, sau đó hút vào một dòng nước biển giàu chất dinh dưỡng ổn định để bọt biển lọc và ăn. Những dòng nước này thậm chí có thể chạy ngược với dòng điện xung quanh trong vùng nước xung quanh của đại dương.
Bọt biển là sinh vật cộng đồng bao gồm các thuộc địa của tế bào. Các tế bào hoạt động kết hợp với nhau làm cho bọt biển trở thành một sinh vật sống có thể kiếm ăn và sinh sản, nhưng các tế bào này cũng đáng chú ý là độc lập với nhau hơn nhiều so với tế bào của một loài động vật điển hình.
Một số loài bọt biển biểu hiện hành vi ăn thịt, ăn thịt một số loài giáp xác và các sinh vật biển khác. Chúng thực hiện được điều này vì con mồi bám chặt vào chúng nhờ bề mặt xù xì, có móc để bám vào vỏ giáp xác và các con mồi khác.