Đuôi của rùa đực thường dày hơn ở gốc so với rùa cái, và các móng vuốt trước và sau cũng dài hơn đối với con đực. Con đực cũng có thể có màu cam hoặc đỏ ở mắt so với con cái có mắt thường màu nâu. Cuối cùng, hậu môn của rùa đực trưởng thành nằm ngoài rìa mai, trong khi đối với rùa cái, hậu môn thường được giấu đi.
Vì cơ quan sinh dục của rùa hộp nằm bên trong mai nên việc phân biệt giới tính của một con rùa còn rất nhỏ là vô cùng khó khăn. Có thể mất đến 4 năm để rùa đạt đến độ tuổi trưởng thành và sau đó là 16 năm nữa trước khi trưởng thành. Tuổi thọ của rùa hộp rất dài. Ví dụ, rùa hộp phía đông có thể sống tới 40 năm trong tự nhiên và 100 năm trở lên trong điều kiện nuôi nhốt.
