Phân biệt chủng tộc ở Hoa Kỳ đã xuất hiện từ những năm 1400, bắt đầu khi những người định cư châu Âu bắt đầu đô hộ Mỹ. Người châu Âu, trong hành trình tìm cách "khai hóa" mọi người, bắt đầu bắt làm nô lệ và đối xử với những người trông khác biệt từ họ là kém hơn.
Các hành vi phân biệt chủng tộc đầu tiên đã diễn ra đối với người Mỹ bản địa. Khi người châu Âu đổ bộ vào châu Mỹ, họ đã chinh phục người da đỏ trong các cuộc chiến tranh và thảm sát. Những người còn sống phải chịu đựng thông qua các hiệp ước cưỡng bức, hạn chế lương thực và chiếm đoạt đất đai. Những người định cư châu Âu cố gắng ép buộc Cơ đốc giáo đối với người Mỹ bản địa và những người không tuân theo thường bị trừng phạt.
Người Mỹ gốc Phi là tâm điểm của nạn phân biệt chủng tộc kể từ khi những người thực dân Anh đầu tiên định cư Virginia. Họ bị bắt làm nô lệ và thường xuyên bị đánh đập, bỏ đói và bị đối xử như súc vật.
