Đức Phanxicô II của Pháp qua đời khi mới 16 tuổi do áp xe trong não. Điều này là do nhiễm trùng tai lan nhanh và dẫn đến sưng to.
Đức Phanxicô II của Pháp bị bệnh tật trong suốt cuộc đời ngắn ngủi của mình. Khi còn nhỏ, ông thường xuyên ốm đau và rất yếu. Năm 1558, Francis II kết hôn với Mary Queen of Scots, một người bạn thời thơ ấu, trong một cuộc hôn nhân sắp đặt. Năm sau, Francis II lên ngôi, nhưng triều đại của ông chỉ kéo dài hơn một năm trước khi ông bị nhiễm trùng tai cấp tính. Nguyên nhân chính thức của cái chết là áp xe não do sưng tấy do nhiễm trùng tai.