Tổng cộng, Nhật Bản có 6.852 hòn đảo. Tuy nhiên, định nghĩa này chỉ bao gồm các đảo có chu vi 100 mét hoặc lớn hơn; định nghĩa ít hạn chế hơn sẽ dẫn đến số lượng cao hơn nhiều, trong khi định nghĩa hạn chế hơn sẽ dẫn đến số lượng thấp hơn. Chỉ có 430 hòn đảo của Nhật Bản có người sinh sống.
Hầu hết người dân Nhật Bản sống trên bốn hòn đảo: Hokkaido, Honshu, Shikoku và Kyushu. Trong số này, Honshu là lớn nhất và đông dân nhất với biên độ rộng; nó cũng là hòn đảo lớn thứ bảy trên thế giới, với tổng chiều dài 810 dặm. Một trong những hòn đảo nhỏ nhất ở Nhật Bản, Aogashima, chỉ có 205 người vào năm 2009, trong đó có 25 sinh viên.
