Theo PETA, chuột là loài động vật thông minh vượt trội trong việc học các kỹ năng và khái niệm mới. Chuột có khả năng được huấn luyện và học nhiều thủ thuật khác nhau, giống như loài chó. Hiệp hội Hỗ trợ và Dạy học Chuột tuyên bố rằng một số loài chuột thậm chí còn thông minh hơn cả loài chó. Chuột cũng đủ thông minh để nhận ra tên của chúng và đến khi được gọi.
Chuột thể hiện nhiều cảm xúc giống như con người, chẳng hạn như cô đơn, lo lắng, trầm cảm và căng thẳng. Những cảm xúc này thường trải qua khi chúng không có sự đồng hành của những con chuột khác hoặc chủ nhân là con người. Các nghiên cứu chỉ ra rằng chuột cũng trải qua cảm giác hối tiếc vì những cơ hội bị bỏ lỡ.
Chuột là loài động vật có tính xã hội cao, giao tiếp thông qua xúc giác, khứu giác và âm thanh tần số cao mà thính giác của con người không thể nghe được. Chúng trở nên vô cùng gắn bó với những con chuột khác hoặc gia đình con người của chúng, và chúng thể hiện rất nhiều tình cảm đối với chúng. Chúng thể hiện điều này thông qua việc âu yếm, liếm láp và chải chuốt. Một nghiên cứu được thực hiện bởi nhà thần kinh học Jaak Panksepp đã phát hiện ra rằng những con chuột cười khi chúng bị cù và trong khi chơi. Nghiên cứu cũng cho thấy những con chuột gắn bó xã hội với những con người cù chúng để cố gắng được cù nhiều hơn. Người ta cũng phát hiện ra rằng những con chuột bị mất bạn đồng hành thường than khóc về sự mất mát đó và đôi khi chết vì buồn.