Chipmunks ngủ đông trong mùa đông, mặc dù chúng không tích trữ chất béo. Thay vì ngủ trong suốt thời gian đó, chúng thức dậy vài ngày một lần.
Trong thời gian ngủ đông, sóc chuột đi vào giấc ngủ sâu, do đó chúng có thể rất khó cử động hoặc bị kích thích. Nhịp tim của họ giảm từ 350 nhịp /phút xuống còn 4 nhịp /phút. Ngoài ra, nhiệt độ cơ thể giảm từ 94 độ F xuống nhiệt độ trong lỗ. Chế độ ngủ đông này cho phép chúng sống sót qua mùa đông. Tuy nhiên, sóc chuột ở những khu vực ấm hơn ít có khả năng ngủ đông trong mùa lạnh. Chipmunks ăn các loại hạt và quả hạch dự trữ trong suốt mùa đông khi ngủ đông.