Nguồn gốc của cái tên "Wisconsin" đã được tranh luận rất nhiều, nhưng nhiều nhà sử học tin rằng nó có nguồn gốc từ từ "Meskonsing" của người Mỹ da đỏ ở Miami, có nghĩa là "con sông chảy qua một nơi màu đỏ". Meskonsing là tên ban đầu của sông Wisconsin, nơi có các bờ bằng đá sa thạch đỏ.
Meskonsing là cách viết tiếng Pháp của tên người da đỏ ở Miami là "Meskousing" hoặc "Mescousin". Năm 1674, nhà thám hiểm Rene Robert Cavelier, Sieur de La Salle đã vô tình truyền bá cách phát âm tiếng Pháp "Ouisconsin" sau khi đọc sai các chữ thảo trong nhật ký của một nhà truyền giáo. Vào những năm 1820, các chính trị gia Mỹ dần dần áp dụng cách đánh vần phiên âm tiếng Anh là "Wisconsin" và phổ biến cách sử dụng nó bằng cách đưa nó vào các ấn phẩm của chính phủ. Đến tháng 7 năm 1836, phiên bản hiện đại này được chấp nhận là cách viết chính thức.