Vùng nước nổi tiếng nhất ở Boliva là Hồ ("Lago" trong tiếng Tây Ban Nha) Titicaca, hồ lớn nhất ở Nam Mỹ và là hồ có khả năng điều hướng thương mại cao nhất trên Trái đất. Các hồ khác trong lưu vực Altiplano bao gồm Poopó, Salar de Coipasa, Salar de Uyuni và Uru Uru. Các hồ trong lưu vực Altiplano từ lợ đến mặn. Các hồ nước ngọt ở vùng đất thấp bao gồm Huaytunas, Rogaguado, Rogagua, Guachuna và El Océano.
Con sông đáng chú ý nhất ở Bolivia là Amazon. Các sông lớn khác trong lưu vực sông Amazon bao gồm Madiera, Beni, Madre de Dios, Mamoré, Yata, Iténez (còn được gọi là Guaporé), Itonmas (còn được gọi là San Miguel, San Julián hoặc San Pablo), Río Blanco (còn được gọi là Baures hoặc Agua Caliente), San Martin, Río Grande (còn được gọi là Guapay) và Acre. Lưu vực La Plata chứa các sông Paraguay, Bermejo và Pilcomayo.
Sol de Mañana là một mạch nước phun ở vùng Potosi của Tây Nam Bolivia. Eo biển Tiquina là kênh nối hai nửa của Hồ Titicaca, Hồ Chicuito lớn hơn và Hồ Pequeno nhỏ hơn.
Bolivia không giáp biển và không kết nối với biển theo bất kỳ hướng nào, mặc dù Hồ Titicaca đủ lớn để có tác dụng giảm thiểu khí hậu xung quanh.
