Theo About.com, hổ Java bị tuyệt chủng chủ yếu do môi trường sống tự nhiên của chúng bị phá hủy và được nuôi trồng vì lợi ích của loài người đang tăng nhanh. Chúng bị săn lùng và đầu độc, và bị coi là là loài gây hại vì mức độ phổ biến của chúng ở Java vào đầu thế kỷ 19. Cạnh tranh giành con mồi cũng gia tăng khi chó hoang du nhập vào Java.
Sau Thế chiến thứ hai, nhiều khu rừng tự nhiên đã bị phá hủy để làm đồn điền, được sử dụng cho gỗ tếch, cà phê và cao su. Sự chia cắt này của các khu rừng đã làm cho môi trường sống tự nhiên không còn thích hợp để hỗ trợ sự sống của động vật. Loài săn mồi quan trọng nhất của hổ Java, hươu rusa, đã bị dịch bệnh hoành hành ở nhiều khu rừng và khu bảo tồn trong những năm 1960, góp phần vào sự sụp đổ của loài hổ này.
Mặc dù đã có những lần nhìn thấy chưa được xác nhận kể từ đó, nhưng lần nhìn thấy hổ Java gần đây nhất được ghi nhận là vào năm 1972 và IUCN tuyên bố hổ Java chính thức tuyệt chủng vào năm 2003. Đến cuối thời kỳ tồn tại của hổ Java, chúng được quy định đến vùng ngoại ô của đảo Java và Núi Betin có nhiều người sinh sống nhất, là phần cao nhất và xa nhất của hòn đảo.
Mặc dù lớn hơn hổ Bali, hổ Java là một phân loài tương đối nhỏ trong số các loài hổ lục địa châu Á.
