Nguyên nhân phổ biến nhất gây ra các đốm đen trên cá vàng là chấn thương và kích ứng do nồng độ amoniac cao trong nước. Amoniac cao thực sự làm cháy vảy, dẫn đến các mảng trắng. Các đốm đen xuất hiện khi vảy bắt đầu lành lại.
Bỏng amoniac có thể dễ dàng điều trị bằng cách loại bỏ amoniac dư thừa khỏi bể cá. Khi nồng độ amoniac cân bằng, các mảng trắng bắt đầu lành lại, dẫn đến các đốm đen. Amoniac dư thừa xảy ra khi thức ăn không tiêu hóa bắt đầu phân hủy trong bể cá. Nồng độ amoniac cao cũng phổ biến trong các bể cá quá đông đúc, do chất thải cá quá nhiều. Thay nước đúng cách và làm sạch bể có thể giúp cân bằng mức amoniac.
Bệnh đốm đen là một bệnh hiếm gặp do ốc sên tiếp xúc với phân chim mang theo. Nếu vô tình thả những con ốc bị nhiễm bệnh vào bể, chúng có thể truyền bệnh cho cá vàng. Ký sinh trùng chui vào lớp vảy và tạo thành một u nang cứng màu đen. Bệnh đốm đen tương đối vô hại ở cá vàng, và trong nhiều trường hợp, các u nang tự biến mất. Vì không có cách nào chắc chắn để biết ốc có mang mầm bệnh hay không, nên cách tốt nhất để ngăn ngừa bệnh đốm đen là không cho tất cả ốc ra khỏi bể nuôi.