Mặc dù ăn cá ngừ có lợi cho sức khỏe, chẳng hạn như bổ sung axit béo omega-3 trong cơ thể, Tổ chức Bảo vệ Đạo đức Đối với Động vật (PETA) cảnh báo mọi người không nên ăn quá nhiều vì có thể bị ngộ độc thủy ngân. Một cậu bé tuổi teen đã được coi là một ví dụ về một người đã phải chịu đựng chất độc thủy ngân. Chàng trai trẻ gặp khó khăn trong việc tập trung và chơi bóng vì tiêu thụ quá nhiều cá ngừ đóng hộp.
Cá ngừ chứa nhiều kim loại nặng vì nó ăn cá bị ô nhiễm. Đổi lại, khi con người tiêu thụ số lượng lớn cá ngừ, các kim loại nặng sẽ được chuyển sang chúng. Kim loại nặng tấn công tim và các nghiên cứu đã chỉ ra rằng những người đàn ông có hàm lượng thủy ngân trong máu cao nhất sẽ làm tăng nguy cơ đau tim và bệnh tim, theo PETA.
Một tác dụng phụ khác từ việc tiêu thụ quá nhiều cá ngừ là khả năng ăn phải cá bị bệnh. Nhiều loài cá ngừ đại dương không còn được đánh bắt ở vùng nước mở mà thay vào đó được nuôi trong các trang trại. Các trang trại là các chuồng cá quá đông, nơi cá ngừ có thể mắc bệnh và ký sinh trùng từ các khu vực gần đó. Một loại cá ngừ khác có thể gây tác dụng phụ là cá ngừ dùng làm sushi. PETA chia sẻ với độc giả rằng cá chưa nấu chín có thể chứa vi khuẩn gây ngộ độc thực phẩm. Hải sản là nguyên nhân số một trong các vụ ngộ độc thực phẩm. Ngộ độc thực phẩm có thể trở nên nghiêm trọng đến mức phải nhập viện hoặc dẫn đến tử vong.