Sự khác biệt cơ bản giữa hô hấp hiếu khí và kỵ khí là hô hấp hiếu khí bao gồm việc sử dụng oxy trong khi hô hấp kỵ khí không liên quan đến oxy. Hô hấp tế bào là cách tế bào sản xuất năng lượng dưới dạng phân tử adenosine triphosphate.
Hô hấp hiếu khí cũng tạo ra nhiều năng lượng hơn hô hấp kỵ khí. Điểm khác biệt cuối cùng giữa hai loại hô hấp là hô hấp hiếu khí tạo ra khí cacbonic và nước dưới dạng các sản phẩm, trong khi hô hấp kỵ khí tạo ra axit lactic.Các chuyên gia thể dục thường sử dụng cả hai thuật ngữ để phân biệt giữa các loại bài tập. Theo WebMD, các bài tập aerobic là những thói quen tốt cho tim mạch như đi bộ, leo các bước và đi bộ đường dài mà mọi người có thể duy trì trong thời gian dài khi hít thở. Các bài tập kỵ khí có cường độ cao nên người tập chỉ duy trì được trong thời gian ngắn vì thiếu ôxy. Các bài tập này bao gồm đẩy tạ.