Có một số nhược điểm đối với hệ thống POS, bao gồm cả việc gia tăng khó khăn trong việc giảng dạy hệ thống và chi phí. Các hệ thống POS ngày nay thường phổ biến hơn trước đây, nhưng nhiều cửa hàng vẫn dựa vào máy tính tiền do chi phí và hiệu quả.
Máy tính tiền có ít thành phần hơn hệ thống POS, có nghĩa là nó ít có khả năng được sử dụng để tính lương, dữ liệu nhân viên, lưu trữ hồ sơ và các hoạt động kinh doanh thông thường khác. Chính vì vậy mà máy tính tiền dễ học hơn rất nhiều. Có ít cách để mắc lỗi hơn và không có nhiều chương trình đáng lo ngại trên máy.
Trước tiên, các chủ doanh nghiệp nhỏ có thể bắt đầu với máy tính tiền và tránh chuyển sang hệ thống POS. Đó là bởi vì chi phí là một yếu tố chính đối với những người tìm kiếm máy tính tiền so với hệ thống POS. Một máy tính tiền mới thường ít tốn kém hơn một hệ thống POS mới và khi điều này kết hợp với chi phí đào tạo bổ sung, nó có thể dẫn đến việc các cửa hàng gắn bó với thiết lập dựa trên máy tính tiền.
Những người khác có thể không cần tất cả các tính năng của hệ thống POS. Nếu việc trả lương được thực hiện trên giấy hoặc việc bán hàng được nhân viên xử lý hàng đêm, điều đó có thể khiến hệ thống POS trông quá đắt so với những lợi ích cộng thêm không cần thiết.