Người Công giáo La Mã và những người theo đạo Báp-tít miền Nam khác nhau về niềm tin của họ về thẩm quyền tuyệt đối, phép rửa tội, Kinh thánh và sự xá tội. Họ cũng tin khác nhau về giá trị và ý nghĩa của việc Rước lễ cũng như mức độ quyền hạn mà các nhà lãnh đạo Hội thánh trao cho.
Trong khi người Công giáo La Mã tin rằng những người lãnh đạo nhà thờ có thẩm quyền tuyệt đối, thì những người theo đạo Báp-tít miền Nam tin vào thẩm quyền tối thượng của Kinh thánh. Họ xem nó như một cẩm nang hướng dẫn để sống theo ý định của Đức Chúa Trời và không tin rằng nó có sai sót. Người Công giáo La mã không tin rằng Kinh thánh là không thể sai lầm. Họ tin vào lẽ thật của Kinh thánh được nhà thờ giải thích. Họ cũng tìm thấy sự thật trong truyền thống của mình.
Những người theo đạo Báp-tít miền Nam xem phép báp têm hoàn toàn mang tính biểu tượng và là một phương tiện làm chứng về việc được cứu, không phải là một phương tiện để được cứu. Họ không rửa tội cho trẻ sơ sinh. Người Công giáo La Mã rửa tội cho trẻ sơ sinh và coi lễ rửa tội là một bí tích và điều kiện tiên quyết để được cứu rỗi.
Những người theo đạo Báp-tít miền Nam rước lễ để tôn vinh và tưởng nhớ cái chết của Chúa Giê-su, trong khi người Công giáo La Mã đặt ý nghĩa lớn hơn trong bí tích Rước lễ. Họ tin rằng những chiếc bánh Rước lễ tượng trưng cho thân thể của Chúa Giê-su Christ và rượu vang tượng trưng cho máu của Ngài, và bằng cách rước lễ, họ trở nên gần gũi hơn với Đức Chúa Trời.
Người Công giáo La Mã tin rằng Giáo hoàng là không thể sai lầm và công nhận hệ thống cấp bậc trong nhà thờ, để nó ra lệnh cho cách vận hành của các nhà thờ riêng lẻ. Những người theo đạo Báp-tít miền Nam không tin các giám mục có quyền lực tuyệt đối. Nhà thờ của họ hoạt động mà không có sự hướng dẫn và tiến hành công việc kinh doanh khi họ cho là phù hợp.
