Ngoài đặc điểm nổi tiếng nhất là kênh đào nhân tạo chia cắt nó, Cộng hòa Panama còn có những ngọn núi hiểm trở, đồng bằng ven biển và những ngọn đồi trập trùng. Dải đất mỏng mà Bao gồm quốc gia rộng 29.157 dặm vuông là một eo đất nối liền các lục địa Bắc Mỹ và Nam Mỹ. Kênh đào Panama, được hoàn thành vào năm 1914, cho phép tàu bè qua lại giữa Đại Tây Dương và Thái Bình Dương nằm ở phía bắc và phía nam của eo đất Panama.
Panama là quốc gia ở cực nam Trung Mỹ và giáp với Colombia ở phía Nam Mỹ và Costa Rica ở phía Trung Mỹ. Cột sống trung tâm của đất nước với núi và đồi nội địa là đặc điểm địa hình chủ đạo của quốc gia. Các đỉnh của cột sống này được hình thành do sự xâm nhập của núi lửa và vùng núi là kết quả của sự nâng lên bắt nguồn từ đáy biển. Toàn bộ dãy núi, chạy từ Costa Rica ở phía tây bắc và xuống đến kênh đào, thường được gọi là Trung tâm Cordillera. Điểm cao nhất ở Panama là đỉnh núi Volcan Baru ở độ cao 11.401 feet.
Có một khu rừng rậm gần như bất khả xâm phạm, được gọi là Darien Gap, ở điểm mà Panama giáp với Colombia. Khu vực này là điểm đứt gãy duy nhất trong toàn bộ hệ thống đường cao tốc Liên Mỹ nối Alaska với vùng Patagonia ở miền nam Argentina.
