Các biểu tượng giả kim thuật đại diện cho các hợp chất và nguyên tố liên quan đến nghệ thuật giả kim. Các biểu tượng này khác nhau giữa các nhà giả kim, nhưng một số biểu tượng phổ biến hơn những biểu tượng khác; ví dụ: "tria prima" của Paracelsus, trong đó hình tròn có đường thẳng ở giữa tượng trưng cho muối, hình tam giác trên đỉnh cây thánh giá tượng trưng cho lưu huỳnh và hình tròn giữa hình bán nguyệt và hình chữ thập tượng trưng cho thủy ngân.
Các biểu tượng giả kim thuật phổ biến khác bao gồm các biểu tượng của Truyền thống Bí truyền phương Tây, trong đó hình tam giác đại diện cho bốn yếu tố. Một hình tam giác tượng trưng cho lửa, một hình tam giác lộn ngược tượng trưng cho nước, một hình tam giác có đường đi qua tâm tượng trưng cho không khí và một hình tam giác lộn ngược với đường thẳng đi qua tâm tượng trưng cho đất. Một hệ thống khác là biểu tượng kim loại hành tinh trong đó mặt trời, mặt trăng và năm hành tinh được liên kết với một số nguyên tố nhất định. Trong hệ thống này, mặt trời liên kết với vàng, mặt trăng với bạc, sao Kim với đồng, sao Hỏa với sắt, sao Mộc với thiếc, sao Thổ với chì và sao Thủy với thủy ngân. Một biểu tượng giả kim thuật phổ biến khác là Hòn đá Triết gia, bao gồm một vòng tròn bên trong một hình vuông, bên trong một hình tam giác, bên trong một vòng tròn. Nửa trên đại diện cho thế giới tâm linh và nửa dưới đại diện cho thế giới vật chất.
