Lượng mưa trung bình hàng năm trên rạn san hô Great Barrier là 78,75 inch. Lượng mưa trung bình thay đổi tùy theo vị trí của rạn san hô.
Phần lớn lượng mưa trên rạn san hô Great Barrier xảy ra trong mùa mưa. Phần này bắt đầu vào tháng 11 và kết thúc vào tháng 3.
Rạn san hô được tìm thấy ở các địa điểm trên khắp thế giới, nhưng phát triển mạnh nhất ở vùng nước nông ấm. Rạn san hô lớn được tìm thấy ở những vùng khí hậu có nhiệt độ trung bình là 77 và 87,8 độ F.
Nước xung quanh rạn san hô phải trong để có thể nhận được ánh sáng mặt trời. Ánh sáng mặt trời dồi dào là yếu tố quan trọng đối với sức khỏe tổng thể của rạn san hô.