Sông Missouri lấy tên từ một bộ tộc da đỏ Sioux gọi là Missouris. Bộ lạc này đã đặt tên cho cả bang và dòng sông của họ. Theo Cục Dân tộc học Hoa Kỳ thuộc Viện Smithsonian, "Missouri" được dịch là "thị trấn của những chiếc ca nô lớn."
Các nhà chức trách khác đã tuyên bố bản dịch là "anh ấy của chiếc ca nô lớn" hoặc "những người đi ca nô gỗ". Sông Missouri chảy xuống từ dãy núi Rocky ở Montana trong 2.341 dặm rồi đổ vào sông Mississippi ở phía bắc St. Louis. Nó là con sông dài nhất ở Hoa Kỳ và trên thực tế là ở toàn bộ Bắc Mỹ.
