Rắn thải cả chất thải ở đường tiêu hóa và chất thải đã lọc của cơ thể ra khỏi một lỗ duy nhất được gọi là cloaca, Snake Removal cho biết. Chúng bài tiết chất thải không thường xuyên. Chất thải tạo thành có xu hướng là một khối mềm, nhầy nhụa, có thể có các vệt trắng trong đó.
Giống như hầu hết các loài bò sát, thận của rắn được thiết kế để tiết kiệm nước. Chất thải được lọc ra khỏi máu bởi thận sẽ được chuyển hóa thành axit uric. Chất thải đó sau đó sẽ được lắng đọng vào ống quần của con rắn, nơi phần lớn nước được tái hấp thu, chỉ để lại một hỗn hợp đặc sệt màu trắng.
Rắn thường nuốt trọn con mồi. Sau khi được nuốt, thức ăn sẽ được tiêu hóa trong dạ dày và ruột. Thức ăn đã tiêu hóa được hấp thụ qua thành ruột non. Chất cặn còn lại di chuyển qua ruột già vào khoang trên của cục máu đông, nơi một số nước được tái hấp thu. Tạp chí Reptile cho biết, sau đó nó sẽ đi vào khoang sau của cloaca để trộn với chất thải axit uric. Chất tạo thành được đào thải ra ngoài.