Các loài khỉ khác nhau có nguy cơ tuyệt chủng vì những lý do khác nhau, nhưng một trong những nguyên nhân chính gây ra nguy cơ tuyệt chủng cho khỉ là do môi trường sống bị phá hủy, bao gồm cả sự chia cắt rừng. Một lý do phổ biến khác dẫn đến nguy cơ tuyệt chủng của khỉ là săn bắn.
Một loài khỉ có nguy cơ tuyệt chủng là khỉ nhện đen, sống ở Mỹ Latinh. Chúng là thành viên của hệ sinh thái rừng mưa nhiệt đới. Những con khỉ này chọn sống trong những khu rừng trưởng thành dễ bị tổn thương bởi các hoạt động chia cắt rừng, nơi những cây già bị chặt ở những khu vực ngẫu nhiên trong rừng.
Một loài khỉ có nguy cơ tuyệt chủng khác là khỉ vòi từ đảo Borneo. Chúng có nguy cơ tuyệt chủng vì môi trường sống bị phá hủy. Người dân trên đảo thường xuyên vào rừng để tạo nhà và chặt cây.
