Những kẻ săn mồi của sinh vật phù du bao gồm cá voi, cá mập và nhiều loại động vật không xương sống khác nhau. Nhiều loài sinh vật phù du ăn các loại sinh vật phù du khác, thậm chí đôi khi còn ăn thịt đồng loại của chúng.
Các loài săn mồi sinh vật phù du có rất nhiều và bao gồm cả cá voi tấm sừng hàm, chẳng hạn như cá voi lưng gù, cá mập đáy và cá mập voi. Sinh vật phù du cũng được tiêu thụ bởi các loài giáp xác và nhiều loại cá, cả lớn và nhỏ. Ngay cả san hô và hải quỳ cũng tìm kiếm các sinh vật phù du khi nó có sẵn, tóm lấy hoặc tóm lấy nó khi nó trôi theo dòng chảy. Những sinh vật khác, từ sứa và động vật chân đốt đến mực, cũng săn sinh vật phù du. Các phiên bản nhỏ hơn của nhiều loài động vật giống nhau săn mồi sinh vật phù du, chẳng hạn như sứa nhỏ, thường là một phần của sinh vật phù du.
Bản thân sinh vật phù du được tạo thành từ hai loại sống cực nhỏ; động vật phù du bao gồm các động vật nhỏ bé, trong khi thực vật phù du bao gồm các thực vật cực nhỏ. Sinh vật phù du là cơ sở của toàn bộ chuỗi thức ăn đại dương và thường là lý do đằng sau những cuộc di cư hoành tráng của động vật. Vào một số thời điểm nhất định trong năm, sinh sản thực vật phù du bùng nổ khi nở rộ. Điều này là do quá trình quang hợp tăng lên trong những tháng mùa hè và đôi khi tạo ra một bông hoa lớn có thể nhìn thấy từ không gian như một vệt xanh trên đại dương.