Cá voi sát thủ, một số loài cá mập, sói Bắc Cực, gấu Bắc Cực, báo sư tử, linh cẩu nâu, các loài canid khác nhau và thậm chí các loại hải cẩu khác săn mồi hải cẩu. Một số loài hải cẩu không có bất kỳ động vật ăn thịt tự nhiên nào do nơi chúng sống hoặc kích thước của chúng.
Cá voi sát thủ hay còn gọi là cá orcas là mối đe dọa lớn nhất đối với hải cẩu. Cá voi sát thủ sử dụng chiếc đuôi mạnh mẽ của mình để lật hải cẩu trong không khí và tát chúng, và chúng cũng dùng đầu để húc vào hải cẩu. Hải cẩu thường bị săn đuổi nhất bởi các nhóm lên đến 10 con cá voi sát thủ, mặc dù một số đi du lịch và săn theo nhóm lớn hơn hoặc một mình. Hải cẩu non là mục tiêu chính của cá voi sát thủ, mặc dù con trưởng thành cũng bị săn đuổi.
Các loài cá mập lớn, như cá mập hổ, cá mập mako và đặc biệt là cá mập trắng lớn, cũng là những kẻ săn mồi chính của hải cẩu. Cá mập tấn công hải cẩu bằng cách rình mò chúng từ bên dưới, và nhiều con hải cẩu sống sót với vết thương. Gấu Bắc Cực chủ động rình rập hải cẩu trên băng hoặc trên mặt nước, và đôi khi chúng thích ngồi và đợi cho đến khi con mồi không nghi ngờ đến gần. Những kẻ săn mồi trên cạn như báo sư tử, linh cẩu và các loài chó khác nhau, có xu hướng săn hải cẩu con vì chúng dễ nhắm mục tiêu hơn hải cẩu trưởng thành. Hải cẩu báo hoa mai được biết đến là loài săn và ăn thịt nhiều loài hải cẩu khác.
