Hy Lạp được bao quanh bởi các vùng nước lớn, bao gồm Biển Ionian, Biển Địa Trung Hải, Biển Crete, Biển Thracia và Biển Aegean. Nhiều hòn đảo của đất nước này đều nằm trong năm vùng biển này.
Trong nội địa của Hy Lạp, có rất ít hồ quan trọng. Các hồ lớn nhất bao gồm Hồ Prespa, Hồ Trihonida và Hồ Pamvotida. Đất nước này cũng là nơi có nhiều con sông, bao gồm Evros, Axios, Pineios và Acherodas. Một trong những thắng cảnh đẹp nhất là sông Nestos ở Xanthi. Những con sông có lượng nước nhỏ hơn có xu hướng khô cạn khi nhiệt độ tăng vào mỗi mùa hè.