Các quốc gia láng giềng của Nhật Bản là Hàn Quốc, Triều Tiên, Nga và Trung Quốc. Nhật Bản là một quốc gia quần đảo nằm ở phía đông châu Á và được bao quanh bởi Bắc Thái Bình Dương và Biển Nhật Bản.
Bốn hòn đảo chính của Nhật Bản là Honshu, Kyushu, Hokkaido và Shikoku. Bán đảo Triều Tiên cách đảo Kyushu khoảng 124 km, trong khi bờ biển Nga cách đảo Hokkaido 186 km, mặc dù đảo Shakhalin của Nga chỉ cách Nhật Bản 23 km. Địa hình của Nhật Bản chủ yếu là đồi núi với các hoạt động địa chấn thường xuyên xảy ra do có nhiều núi lửa đang hoạt động bao quanh đất nước.