Các địa hình chính ở Mississippi bao gồm Đồng bằng Mississippi; Đồng bằng ven biển; đất ngập nước ven biển; Sông Mississippi, Pearl, Big Black và Yazoo; Hồ chứa Ross Barnett; Âm thanh Mississippi; và các hồ Enid, Grenada và Sardis. Các địa hình quan trọng khác bao gồm Sông Pascagoula, Sông Tombigbee, Hồ Arkabutla, Dãy núi Cumberland, Vịnh St. Louis, Vịnh Biloxi, Vịnh Pascagoula và Đồng bằng Mississippi.
Độ cao cao nhất ở Mississippi là ở chân đồi của Dãy núi Cumberland trên Núi Woodall, cao hơn mực nước biển 807 bộ, trong khi độ cao thấp nhất được tìm thấy ở mực nước biển dọc theo Bờ biển Vịnh. Đồng bằng ven biển Vịnh Đông bao gồm hầu hết tiểu bang, bao gồm các ngọn đồi thấp của Pine Hills và North Central Hills. Hồ Sardis là hồ lớn nhất ở Mississippi, với diện tích bề mặt là 98.520 mẫu Anh và thể tích 1,51 triệu mẫu Anh. Nó được nuôi dưỡng bởi sông Little Tallahatchie. Đồng bằng Mississippi là khu vực được giới hạn bởi sông Mississippi và sông Yazoo và là một phần của đồng bằng phù sa Mississippi. Con sông dài nhất trong tiểu bang là sông Châu Giang, chảy vào Vịnh Mexico sau một con đường dài 450 dặm. Mississippi Sound là nơi tọa lạc của một số hòn đảo nhỏ là một phần của Bờ biển Quốc gia Quần đảo Vùng Vịnh, bao gồm các đảo Petit Bois, Cat, Ship và Horn.
