Tính đến tháng 11 năm 2015, Johnny Mathis chưa bao giờ kết hôn. Mathis vô tình tự nhận mình là người đồng tính trong một cuộc phỏng vấn năm 1982 cho Tạp chí Us, trong đó anh nói một cách khó hiểu rằng anh đã quen với lối sống đồng tính .
Những bình luận của Mathis trong cuộc phỏng vấn trên Tạp chí Us của anh ấy đã gây tranh cãi và Mathis từ chối làm rõ những tuyên bố của mình, điều này khiến nhiều người hâm mộ không chắc chắn về xu hướng tính dục của anh ấy. Mathis chính thức thừa nhận đồng tính luyến ái của mình trong một cuộc phỏng vấn trên podcast năm 2006, nói rằng sự miễn cưỡng của anh ta trong việc làm rõ những tuyên bố của mình xuất phát từ những lời đe dọa giết chết mà anh ta nhận được khi trả lời bài báo. Mathis cũng thừa nhận rằng việc anh không muốn thừa nhận xu hướng tình dục của mình một phần là do các chuẩn mực xã hội của thế hệ anh.