Nước dùng dinh dưỡng bao gồm peptone và chiết xuất thịt được hòa tan trong nước cất, theo Bio Lab Protocols. Sau khi trộn môi trường, nhà khoa học điều chỉnh độ pH đến 7,0 và khử trùng nước dùng bằng cách sử dụng nhiệt và áp suất của nồi hấp hoặc bộ lọc loại bỏ vi khuẩn.
Các nhà vi sinh vật học sử dụng hai loại môi trường chính để nuôi cấy vi khuẩn, theo Science Prof Online. Môi trường lỏng là nước dùng. Chúng mang lại nhiều thuận lợi cho nhà vi sinh vật học. Nước dùng dinh dưỡng cung cấp các chất dinh dưỡng cần thiết cho vi khuẩn phát triển và duy trì sức khỏe. Tuy nhiên, nước dùng có một nhược điểm là vi khuẩn không phát triển trong môi trường nuôi cấy trong chất lỏng. Trong môi trường nuôi, khi tế bào bố mẹ phân chia, con cái trở thành một phần của hỗn hợp trong ống, nên rất khó xác định xem dịch nuôi cấy có bị ô nhiễm hay không.
Các nhà vi sinh vật học cũng sử dụng đĩa để nuôi cấy. Thạch dinh dưỡng cung cấp cùng một loại thức ăn cho vi khuẩn, nhưng cũng bao gồm thạch, một chất giống như gelatin. Các nhà khoa học đổ thạch vào các đĩa trước khi khử trùng và trải mẫu trên khắp bề mặt thạch bằng một quy trình mà họ gọi là tạo vệt. Vi khuẩn trong mẫu hình thành khuẩn lạc. Mỗi khuẩn lạc phát triển từ một tế bào mẹ và tất cả các vi khuẩn trong khuẩn lạc đều giống hệt nhau về mặt di truyền. Theo Science Prof Online, nhà khoa học có thể đếm số lượng các nền văn hóa phát triển và xác định các nền văn hóa khác với các nền văn hóa còn lại.