Tên thương hiệu thuốc kháng sinh bao gồm Keflex, Zithromax, Levaquin, Bactrim và Tobrex. Mỗi nhãn hiệu này đại diện cho một nhóm thuốc kháng sinh chính. Mặc dù có hơn 100 nhãn hiệu thuốc kháng sinh khác nhau, nhưng tất cả chúng đều thuộc bảy nhóm thuốc.
Bảy nhóm thuốc kháng sinh chính là aminoglycoside, penicillin, macrolide, cephalosporin, fluoroquinolones, tetracycline và sulfonamide. Keflex là một cephalosporin, Zithromax là một macrolide và Levaquin là một fluoroquinolone. Bactrim là một sulfonamide, và Tobrex là một aminoglycoside. Penicillin và tetracycline phần lớn không được cấp bằng sáng chế và thường được gọi bằng tên chung của chúng.
Các nhóm thuốc kháng sinh được xác định bởi cấu trúc hữu cơ của các hợp chất trong nhóm đó, bởi các sinh vật mà kháng sinh được nuôi cấy hoặc tổng hợp hoặc cả hai. Ví dụ, kháng sinh cephalosporin có nguồn gốc từ nấm Cephalosporium acremonium. Kháng sinh macrolid được sản xuất bởi vi khuẩn xạ khuẩn thuộc giống Streptomyces. Chúng cũng thể hiện cấu trúc vòng lacton bao gồm ít nhất 12 thành viên và được liên kết với nhau bằng ít nhất một đường.
Thuốc kháng sinh được chọn cho một số bệnh nhiễm trùng do vi khuẩn nhất định dựa trên một số yếu tố. Chúng bao gồm các loại mầm bệnh thường gây ra một bệnh nhiễm trùng cụ thể, liệu một mầm bệnh cụ thể có nhuộm màu trong phòng thí nghiệm hay không và liệu một sinh vật cụ thể có nhạy cảm với một loại thuốc nhất định hay không. Ngoài ra, có thể cân nhắc chi phí, tác dụng phụ và lịch dùng thuốc.