Bọt biển rất quan trọng vì vai trò của chúng trong việc tái chế chất dinh dưỡng và một phần của chúng trong vòng đời của rạn san hô. Ví dụ, bọt biển phân hủy các chất hữu cơ phức tạp thành thức ăn cho những sinh vật khác sống trên các rạn san hô.
Phần lớn vật chất hữu cơ mà tảo và san hô tạo ra không thể được sử dụng ở dạng hiện tại bởi các cư dân khác của rạn san hô vì tính phức tạp của nó. Đây là nơi mà bọt biển tỏ ra hữu ích. Họ có thể lấy vật liệu phức tạp này và biến nó thành một thứ gì đó đơn giản hơn một chút. Theo Tổ chức Khoa học San hô, phần lớn chế độ ăn uống của chúng bao gồm cacbon hữu cơ hòa tan. Bọt biển cũng giúp giảm nồng độ nitơ trong nước và giữ cho hệ sinh thái trong sạch vì vi khuẩn có trong bọt biển biến nitơ này thành dạng thức ăn.
Mặc dù bọt biển là động vật đa tế bào, chúng cũng có một trong những cấu trúc đơn giản nhất. Thay vì các mô và cơ quan mềm, bọt biển có các lỗ chân lông để đưa nước và chất dinh dưỡng vào bên trong. Nước này sau đó được đẩy ra ngoài qua một lỗ trên đỉnh của miếng bọt biển được gọi là lỗ thông hơi. Bọt biển tự dính vào đá, và chúng có nhiều loại về màu sắc và kích thước. Một số loài bọt biển cũng ăn thịt động vật giáp xác rất nhỏ.