Sư tử biển bị đe dọa chủ yếu bởi cá voi sát thủ và cá mập, đồng thời, với ít cơ chế bảo vệ tự nhiên, chúng cố gắng thoát khỏi những kẻ săn mồi này bằng cách ra khỏi nước và lên đất liền càng nhanh càng tốt. Sư tử biển là những người bơi nhanh hơn cả những kẻ săn mồi tự nhiên của chúng và nếu khỏe mạnh, trưởng thành hoàn toàn và nhận thức được mối đe dọa, có thể dễ dàng né tránh chúng.
Tuy nhiên, đối với sư tử biển nguy hiểm hơn nhiều so với cá voi sát thủ và cá mập đối với con người. Người ta săn sư tử biển để lấy thức ăn, lông tơ, dầu và lông. Những con vật này cũng bị giết để ngăn chúng cạnh tranh với những ngư dân không chỉ muốn bảo toàn sản lượng đánh bắt mà còn muốn bảo vệ lưới đánh cá của họ khỏi những thiệt hại mà sư tử biển gây ra. Vào cuối những năm 1800, các chính phủ cho phép người dân giết sư tử biển để lấy tiền thưởng như một phương pháp kiểm soát dân số.
Sư tử biển không có khả năng phòng vệ trước con người và dân số của chúng chỉ đang tăng lên do nỗ lực của các nhóm bảo tồn làm việc với các chính phủ khác nhau để thông qua luật bảo vệ chúng. Tuy nhiên, những luật này không có trên toàn thế giới. Về tình trạng bảo tồn, sư tử biển được mô tả là dễ bị tổn thương, với các kế hoạch phục hồi được soạn thảo và sẵn sàng thực hiện. Kể từ năm 2014, các tương tác với hoạt động đánh bắt cá thương mại, vướng vào mảnh vỡ và lưới, dầu tràn và sự xáo trộn của con người đều tiếp tục gây hại cho quần thể sư tử biển.
