Phần sâu nhất của lưu vực Đại Tây Dương là Rãnh Puerto Rico, chạy về phía đông từ bờ biển phía bắc của Hispaniola đến một điểm ngoài dãy núi Lesser Antilles. Rãnh này đạt độ sâu tối đa là 28.374 feet , nông hơn Rãnh Marianas của Thái Bình Dương khoảng 8.000 feet.
Rãnh Puerto Rico hình thành dọc theo ranh giới giữa mảng Caribe và mảng Bắc Mỹ. Hiện tượng hút chìm rất ít xảy ra tại lỗi biến đổi giữa các tấm này và hầu hết chuyển động là ngang. Điều này làm giảm hoạt động của núi lửa trong khu vực, nhưng nó làm tăng đáng kể nguy cơ động đất.
