Mặc dù không có một con sông nào đi qua tất cả 13 thuộc địa ban đầu, nhưng có một số con sông chảy qua nhiều bang, chẳng hạn như sông Connecticut. Một số con sông lớn khác chảy qua nhiều bang bao gồm sông Potomac và sông Delaware.
Con sông lớn nhất ở New England là sông Connecticut, kéo dài hơn 400 dặm từ New Hampshire qua Massachusetts và Connecticut đến New York. Những người theo chủ nghĩa thực dân ban đầu sử dụng con sông này để nuôi cá vì đất đai xung quanh làm ruộng kém. Sông Delaware cũng cắt qua phần lớn 13 thuộc địa ban đầu. Bắt đầu từ New York, nó đi 330 dặm qua Pennsylvania, New Jersey và Delaware đến Đại Tây Dương.
Sông Potomac là một vùng nước quan trọng về mặt lịch sử trải dài từ Maryland và Virginia đến Pennsylvania. Những người theo chủ nghĩa thực dân đã từng sử dụng con sông này như một con đường vận chuyển chính và các chủ đồn điền đã từng trồng thuốc lá dọc sông, nhưng việc đốt nương làm rẫy đã tạo thêm phù sa cho dòng sông. Điều này khiến Potomac trở nên quá nông đối với nhiều tàu vận chuyển. George Washington đã chọn thành lập thủ đô Washington D.C của Hoa Kỳ trên sông Potomac vì đây là một trung tâm giao thương chính cũng như là nguồn cung cấp nước uống quan trọng.